Eine Emmy Noether-Gruppe kann an einen thematisch passenden Sonderforschungsbereich am Standort assoziiert werden. Damit ist die Gruppe in ein exzellentes wissenschaftliches Umfeld eingebunden und ihre Leiter*innen partizipieren als vollwertiges Mitglied des Sonderforschungsbereichs an dessen zentralen Mitteln (z.B. Mittel für Gäste, Reisen und Veranstaltungen sowie Pauschale Mittel). Über die Assoziation entscheidet der Sonderforschungsbereichs gemäß seiner Ordnung. Unabhängig von der Assoziation der Emmy Noether-Gruppe können Emmy Noether-Geförderte ein eigenes Teilprojekt im Sonderforschungsbereich einwerben.
Sonderforschungsbereiche werden ermutigt, gezielt geeignete Wissenschaftler*innen früher Karrierephasen anzusprechen und sie auf die Möglichkeiten und Vorteile einer Einbindung einer Emmy Noether-Gruppe aufmerksam zu machen. Ein wichtiger Anreiz für die Einrichtung einer Emmy Noether-Gruppe im Kontext eines Sonderforschungsbereichs kann dabei sein, im Sinne der Strukturbildung vor Ort für die Geförderten bei erfolgreicher Zwischenevaluation eine belastbare Karriereperspektive zu bieten.